MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Archaeoglobus profundus DSM 5631 chromosome

Total Repeats: 29677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29501	NC_013741	CAA	2	6	1550494	1550499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284162937
29502	NC_013741	AT	3	6	1550511	1550516	50 %	50 %	0 %	0 %	284162937
29503	NC_013741	AC	3	6	1550526	1550531	50 %	0 %	0 %	50 %	284162937
29504	NC_013741	AG	3	6	1550592	1550597	50 %	0 %	50 %	0 %	284162937
29505	NC_013741	TG	3	6	1550635	1550640	0 %	50 %	50 %	0 %	284162937
29506	NC_013741	CAG	2	6	1550643	1550648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284162937
29507	NC_013741	GAG	2	6	1550663	1550668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284162937
29508	NC_013741	CGT	2	6	1550680	1550685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284162937
29509	NC_013741	ATT	2	6	1550686	1550691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284162937
29510	NC_013741	GA	3	6	1550793	1550798	50 %	0 %	50 %	0 %	284162937
29511	NC_013741	AG	3	6	1550823	1550828	50 %	0 %	50 %	0 %	284162937
29512	NC_013741	TGGAG	2	10	1550968	1550977	20 %	20 %	60 %	0 %	284162937
29513	NC_013741	TTG	2	6	1551003	1551008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284162937
29514	NC_013741	TGG	2	6	1551055	1551060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284162937
29515	NC_013741	AGA	2	6	1551094	1551099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284162937
29516	NC_013741	A	6	6	1551141	1551146	100 %	0 %	0 %	0 %	284162937
29517	NC_013741	GGCA	2	8	1551200	1551207	25 %	0 %	50 %	25 %	284162937
29518	NC_013741	AGA	3	9	1551240	1551248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284162937
29519	NC_013741	AGG	2	6	1551264	1551269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284162937
29520	NC_013741	AGG	2	6	1551282	1551287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284162937
29521	NC_013741	CAG	2	6	1551294	1551299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284162937
29522	NC_013741	CT	3	6	1551312	1551317	0 %	50 %	0 %	50 %	284162937
29523	NC_013741	AGT	2	6	1551358	1551363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284162937
29524	NC_013741	ACA	2	6	1551368	1551373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284162937
29525	NC_013741	AGA	2	6	1551381	1551386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284162937
29526	NC_013741	GAA	2	6	1551444	1551449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284162937
29527	NC_013741	AGG	2	6	1551479	1551484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29528	NC_013741	TGC	2	6	1551555	1551560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284162938
29529	NC_013741	GAC	2	6	1551834	1551839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284162938
29530	NC_013741	CATAGA	2	12	1551852	1551863	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284162938
29531	NC_013741	ACA	2	6	1552039	1552044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284162938
29532	NC_013741	CTG	2	6	1552091	1552096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284162938
29533	NC_013741	GGT	2	6	1552180	1552185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284162938
29534	NC_013741	TTG	2	6	1552208	1552213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284162938
29535	NC_013741	ATT	2	6	1552231	1552236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284162938
29536	NC_013741	TAC	2	6	1552260	1552265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284162938
29537	NC_013741	TTG	2	6	1552330	1552335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284162938
29538	NC_013741	G	6	6	1552335	1552340	0 %	0 %	100 %	0 %	284162938
29539	NC_013741	CAA	2	6	1552357	1552362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284162939
29540	NC_013741	CTA	2	6	1552404	1552409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284162939
29541	NC_013741	GTA	2	6	1552413	1552418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284162939
29542	NC_013741	AG	3	6	1552437	1552442	50 %	0 %	50 %	0 %	284162939
29543	NC_013741	TCA	2	6	1552450	1552455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284162939
29544	NC_013741	CTG	2	6	1552494	1552499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284162939
29545	NC_013741	TCT	2	6	1552534	1552539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284162939
29546	NC_013741	AGG	2	6	1552547	1552552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284162939
29547	NC_013741	TAC	2	6	1552578	1552583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284162939
29548	NC_013741	GAT	2	6	1552604	1552609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284162939
29549	NC_013741	CGA	2	6	1552693	1552698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284162939
29550	NC_013741	TTG	2	6	1552726	1552731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284162939
29551	NC_013741	TA	3	6	1552763	1552768	50 %	50 %	0 %	0 %	284162939
29552	NC_013741	CTA	2	6	1552826	1552831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284162939
29553	NC_013741	GTTGTG	2	12	1552857	1552868	0 %	50 %	50 %	0 %	284162939
29554	NC_013741	AAG	2	6	1552881	1552886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284162939
29555	NC_013741	TGGACT	2	12	1552895	1552906	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	284162939
29556	NC_013741	AG	3	6	1552917	1552922	50 %	0 %	50 %	0 %	284162939
29557	NC_013741	GCA	2	6	1552932	1552937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284162939
29558	NC_013741	TTC	2	6	1552995	1553000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284162939
29559	NC_013741	TTC	2	6	1553022	1553027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284162939
29560	NC_013741	GAT	2	6	1553084	1553089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284162939
29561	NC_013741	CCT	2	6	1553171	1553176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284162939
29562	NC_013741	AGG	2	6	1553295	1553300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284162939
29563	NC_013741	GT	3	6	1553457	1553462	0 %	50 %	50 %	0 %	284162940
29564	NC_013741	GGA	2	6	1553470	1553475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284162940
29565	NC_013741	TGAG	2	8	1553574	1553581	25 %	25 %	50 %	0 %	284162940
29566	NC_013741	TGGT	2	8	1553604	1553611	0 %	50 %	50 %	0 %	284162940
29567	NC_013741	AT	3	6	1553629	1553634	50 %	50 %	0 %	0 %	284162940
29568	NC_013741	TGA	2	6	1553662	1553667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284162940
29569	NC_013741	CAG	2	6	1553709	1553714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284162940
29570	NC_013741	CTTCTG	2	12	1553780	1553791	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	284162940
29571	NC_013741	GAT	2	6	1553833	1553838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284162940
29572	NC_013741	ATT	2	6	1553843	1553848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284162940
29573	NC_013741	TGA	2	6	1553880	1553885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284162940
29574	NC_013741	CATG	2	8	1553896	1553903	25 %	25 %	25 %	25 %	284162940
29575	NC_013741	GAAA	2	8	1553946	1553953	75 %	0 %	25 %	0 %	284162940
29576	NC_013741	CTT	2	6	1554038	1554043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284162940
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29582	NC_013741	AG	3	6	1554438	1554443	50 %	0 %	50 %	0 %	284162941
29583	NC_013741	AAC	2	6	1554479	1554484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284162941
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29585	NC_013741	AGA	2	6	1554735	1554740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284162941
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29587	NC_013741	TTGGC	2	10	1554841	1554850	0 %	40 %	40 %	20 %	284162942
29588	NC_013741	GAC	2	6	1554907	1554912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284162942
29589	NC_013741	TAT	2	6	1554922	1554927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284162942
29590	NC_013741	CTTG	2	8	1554947	1554954	0 %	50 %	25 %	25 %	284162942
29591	NC_013741	GTG	2	6	1555115	1555120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284162942
29592	NC_013741	TGA	2	6	1555143	1555148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284162942
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29596	NC_013741	AGA	2	6	1555497	1555502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284162942
29597	NC_013741	GAAG	2	8	1555549	1555556	50 %	0 %	50 %	0 %	284162942
29598	NC_013741	AGG	2	6	1555571	1555576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284162942
29599	NC_013741	TAA	2	6	1555628	1555633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284162942
29600	NC_013741	TAG	2	6	1555739	1555744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284162942
29601	NC_013741	GAG	2	6	1555752	1555757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284162942
29602	NC_013741	CAA	2	6	1555776	1555781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284162942
29603	NC_013741	CT	3	6	1555782	1555787	0 %	50 %	0 %	50 %	284162942
29604	NC_013741	CAG	2	6	1555796	1555801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284162942
29605	NC_013741	TGAG	2	8	1555898	1555905	25 %	25 %	50 %	0 %	284162942
29606	NC_013741	AG	3	6	1556026	1556031	50 %	0 %	50 %	0 %	284162942
29607	NC_013741	AACT	2	8	1556169	1556176	50 %	25 %	0 %	25 %	284162943
29608	NC_013741	GCACC	2	10	1556284	1556293	20 %	0 %	20 %	60 %	284162943
29609	NC_013741	TCGA	2	8	1556303	1556310	25 %	25 %	25 %	25 %	284162943
29610	NC_013741	AAC	2	6	1556389	1556394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284162943
29611	NC_013741	ATC	2	6	1556397	1556402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284162943
29612	NC_013741	TC	3	6	1556438	1556443	0 %	50 %	0 %	50 %	284162943
29613	NC_013741	TCT	2	6	1556696	1556701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284162943
29614	NC_013741	GTA	2	6	1556826	1556831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284162943
29615	NC_013741	GAA	2	6	1557024	1557029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284162944
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29617	NC_013741	GA	3	6	1557185	1557190	50 %	0 %	50 %	0 %	284162944
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.